國家“863計劃”現(xiàn)代農(nóng)業(yè)技術(shù)領(lǐng)域通過攻關(guān)篩選并設(shè)計了基于轉(zhuǎn)化事情的通用核酸引物和探針,初步建立了轉(zhuǎn)基因農(nóng)產(chǎn)品品系特異性的精準(zhǔn)檢測技術(shù)體系。
通過查詢網(wǎng)上公用數(shù)據(jù)庫和轉(zhuǎn)基因產(chǎn)品申報材料,系統(tǒng)收集并分析了我國批準(zhǔn)商業(yè)化的25種轉(zhuǎn)基因產(chǎn)品的信息資料。在此基礎(chǔ)上,分析了外源插入載體邊界序列的信息,根據(jù)邊界序列設(shè)計了一系列的特異性引物,利用TAIL-PCR和測序等手段,分離、克隆和鑒定轉(zhuǎn)基因產(chǎn)品的品系特異性序列。結(jié)合目前數(shù)據(jù)庫中公布的部分轉(zhuǎn)基因產(chǎn)品品系特異性序列,成功獲得和收集我國商業(yè)化的19種轉(zhuǎn)基因產(chǎn)品的品系特異性序列,分別是1種轉(zhuǎn)基因大豆、8種轉(zhuǎn)基因玉米、1種轉(zhuǎn)基因番茄、7種轉(zhuǎn)基因油菜、2種轉(zhuǎn)基因棉花。
隨機(jī)設(shè)計了一系列的寡核苷酸鏈,分別對這些寡核苷酸鏈進(jìn)行網(wǎng)上數(shù)據(jù)庫比對,選擇與已有數(shù)據(jù)庫序列同源性較低,尤其是與轉(zhuǎn)基因植物及其外源基因序列同源性低的寡核苷酸鏈作為通用人工序列(UT),并用來設(shè)計通用雙鏈熒光探針。通過仔細(xì)序列比對,選擇 了兩條寡核苷酸鏈作為UT序列以及通用熒光探針的序列。在選擇了合適的UT序列和雙鏈熒光探針后,設(shè)計了一系列的靶序列特異性引物,對通用熒光定量PCR進(jìn)行了優(yōu)化,建立了通用熒光定量PCR反應(yīng)體系。