2006年是“十一五”的開局之年，也是《國家中長期科學和技術(shù)發(fā)展規(guī)劃綱要（2006—2020年）》（以下簡稱《綱要》）的啟動年。年初，黨中央、國務(wù)院召開了全國科技大會，對未來十五年加強自主創(chuàng)新、建設(shè)創(chuàng)新型國家做出了部署。為貫徹落實中央決策，國家財政采取多項措施，大力支持自主創(chuàng)新。
一、加大投入力度，為自主創(chuàng)新提供有力的經(jīng)費保障
財政投入是完成《綱要》任務(wù)、支持自主創(chuàng)新的重要保障。在2006年年初預算安排中，中央財政科技經(jīng)費實現(xiàn)了大幅度增長，達到716億元，增長19.2%，明顯高于中央財政收入的預計增幅。在年度預算執(zhí)行中央財政超收之后，這一比例仍然明顯高于中央財政經(jīng)常性收入的增幅。在中央財政科技經(jīng)費大幅增長的帶動下，很多地方的科技經(jīng)費也大幅增長。
二、優(yōu)化投入結(jié)構(gòu)，建立符合科技工作特點的投入體系
在加大投入的同時，進一步優(yōu)化投入結(jié)構(gòu)，重點支持市場機制不能有效配置資源的基礎(chǔ)研究、前沿技術(shù)研究、社會公益研究、重大共性關(guān)鍵技術(shù)研究開發(fā)等公共科技活動。同時，加大對科研機構(gòu)穩(wěn)定支持的支持力度，使財政科技經(jīng)費更加符合科技工作需要和科研工作規(guī)律。
（一）加大對國家科技計劃（基金）的支持力度
國家科技計劃（基金）是落實《綱要》任務(wù)，提高我國自主創(chuàng)新能力的重要載體。2006年中央財政安排973計劃14億元，安排863計劃60億元。同時，在原國家科技攻關(guān)計劃基礎(chǔ)上，設(shè)立國家科技支撐計劃（以下簡稱“支撐計劃”）。支撐計劃以公益技術(shù)及產(chǎn)業(yè)關(guān)鍵技術(shù)研究開發(fā)與應(yīng)用為重點，結(jié)合重大工程建設(shè)和重大裝備開發(fā)，重點解決涉及全局跨行業(yè)跨地區(qū)的重大技術(shù)問題，2006年安排資金40億元。另外，2006年安排國家自然科學基金35.8億元，比2005年增加8.85億元；安排中科院知識創(chuàng)新工程試點工作39.1億元，比2005年增加6.4億元。
（二）加大對科研機構(gòu)的穩(wěn)定支持力度
科研機構(gòu)是我國科技創(chuàng)新體系的重要組成部分，2006年針對科研機構(gòu)發(fā)展中存在的一些突出問題，加大了對科研機構(gòu)穩(wěn)定支持力度，激發(fā)了科研單位自主創(chuàng)新活力，為其開展科學研究提供了有力保障。一是加大對中央級公益性科研院所的穩(wěn)定支持力度，2006年中央財政新設(shè)“公益性科研院所基本科研業(yè)務(wù)費專項資金”，支持科研院所開展符合公益職能定位，代表學科發(fā)展方向，體現(xiàn)前瞻布局的自主選題研究工作。二是安排中央級公益性科研院所離退休經(jīng)費補助，明確了中央級科研院所離退休經(jīng)費渠道問題，有效解決離退休經(jīng)費擠占在職人員正常事業(yè)費的現(xiàn)象。三是安排中央級科研院所研究生培養(yǎng)經(jīng)費補助，解決科研院所研究生培養(yǎng)沒有專門的經(jīng)費渠道問題。
（三）加強對公益性行業(yè)科研工作的支持
2006年中央財政新設(shè)“公益性行業(yè)科研專項經(jīng)費”，并選擇部分公益特點突出、行業(yè)科研任務(wù)較重的部門，先行開展試點，支持其組織開展本行業(yè)應(yīng)急性、培育性、基礎(chǔ)性科研工作，為行業(yè)發(fā)展提供有力的科技支撐。
（四）加大對科研條件建設(shè)的支持力度
2006年中央財政新設(shè)了“中央級科學事業(yè)單位修繕購置專項資金”，安排資金20億元，有效解決了科技基礎(chǔ)條件的“瓶頸”問題，提高了自主創(chuàng)新能力。同時，2006年安排科技基礎(chǔ)條件平臺建設(shè)專項經(jīng)費7.54億元，支持建設(shè)，整合資源，建立共享機制，有力促進科研能力的提高。
三、加強經(jīng)費管理，提高財政科技經(jīng)費使用效益
2006年，對科技經(jīng)費管理作了較大改革，不斷提高財政科技經(jīng)費使用效益。
（一）提出了關(guān)于改進和加強中央財政科技經(jīng)費管理的基本思路
2006年6月，財政部、科技部印發(fā)了《國務(wù)院辦公廳轉(zhuǎn)發(fā)財政部 科技部關(guān)于改進和加強中央財政科技經(jīng)費管理的若干意見》?！度舾梢庖姟愤M一步明確了科技經(jīng)費管理的思路和原則，即建立保障機制，完善財稅政策，經(jīng)費分類管理，創(chuàng)新支持方式，強化財務(wù)監(jiān)管，提高資金效益。一是完善科技資源配置機制。通過機制體制創(chuàng)新，加強部門之間、地方之間、部門與地方之間、軍民之間的統(tǒng)籌協(xié)調(diào)，促進全社會科技資源高效配置和綜合集成。二是對財政科技經(jīng)費實行分類管理。將中央科技投入分為國家科技計劃（基金等）經(jīng)費、科研機構(gòu)運行經(jīng)費、基本科研業(yè)務(wù)費、公益性行業(yè)科研經(jīng)費、科技條件建設(shè)經(jīng)費等五類。三是創(chuàng)新財政經(jīng)費支持方式，推動產(chǎn)學研結(jié)合。四是健全科研項目立項及預算評審評估制度。建立健全專家咨詢、政府決策的立項機制,建立評審專家?guī)?全面實行網(wǎng)上申報,建立全國統(tǒng)一的科研項目數(shù)據(jù)庫。五是強化科研項目經(jīng)費使用的監(jiān)督管理。
（二）改進科技計劃管理，建立新的國家科技計劃管理制度體系
財政部與有關(guān)部門緊密配合，修訂了973計劃、863計劃、科技支撐計劃等國家科技計劃項目管理辦法，并承擔了相應(yīng)的科技計劃經(jīng)費管理辦法修訂工作。這些辦法目前已全部發(fā)布并開始實施，形成了較為完善的科技計劃管理體系。
