２００８年３月１１日，十一屆全國人大一次會議聽取了國務委員兼國務院秘書長華建敏關于國務院機構改革方案的說明，３月１５日，會議通過關于國務院機構改革方案的決定，批準了這個方案。
國務院機構改革是深化行政管理體制改革的重要組成部分。按照精簡統(tǒng)一效能的原則和決策權、執(zhí)行權、監(jiān)督權既相互制約又相互協(xié)調的要求，著力優(yōu)化組織結構，規(guī)范機構設置，完善運行機制，為全面建設小康社會提供組織保障。深化行政管理體制改革的總體目標是，到２０２０年建立起比較完善的中國特色社會主義行政管理體制。
這次國務院機構改革的主要任務是，圍繞轉變政府職能和理順部門職責關系，探索實行職能有機統(tǒng)一的大部門體制，合理配置宏觀調控部門職能，加強能源環(huán)境管理機構，整合完善工業(yè)和信息化、交通運輸行業(yè)管理體制，以改善民生為重點加強與整合社會管理和公共服務部門。
國務院機構改革方案主要內容包括：（一）合理配置宏觀調控部門職能。國家發(fā)展和改革委員會要進一步轉變職能，減少微觀管理事務和具體審批事項，集中精力抓好宏觀調控。財政部要改革完善預算和稅政管理，健全中央和地方財力與事權相匹配的體制，完善公共財政體系。中國人民銀行要進一步健全貨幣政策體系，加強與金融監(jiān)管部門的統(tǒng)籌協(xié)調，維護國家金融安全。國家發(fā)展和改革委員會、財政部、中國人民銀行等部門要建立健全協(xié)調機制，形成更加完善的宏觀調控體系。（二）加強能源管理機構。設立高層次議事協(xié)調機構國家能源委員會。組建國家能源局，由國家發(fā)展和改革委員會管理。將國家發(fā)展和改革委員會的能源行業(yè)管理有關職責及機構，與國家能源領導小組辦公室的職責、國防科學技術工業(yè)委員會的核電管理職責進行整合，劃入該局。國家能源委員會辦公室的工作由國家能源局承擔。不再保留國家能源領導小組及其辦事機構。（三）組建工業(yè)和信息化部。將國家發(fā)展和改革委員會的工業(yè)行業(yè)管理有關職責，國防科學技術工業(yè)委員會核電管理以外的職責，信息產業(yè)部和國務院信息化工作辦公室的職責，整合劃入工業(yè)和信息化部。組建國家國防科技工業(yè)局，由工業(yè)和信息化部管理。國家煙草專賣局改由工業(yè)和信息化部管理。不再保留國防科學技術工業(yè)委員會、信息產業(yè)部、國務院信息化工作辦公室。（四）組建交通運輸部。將交通部、中國民用航空總局的職責，建設部的指導城市客運職責，整合劃入交通運輸部。組建國家民用航空局，由交通運輸部管理。國家郵政局改由交通運輸部管理。保留鐵道部，繼續(xù)推進改革。不再保留交通部、中國民用航空總局。（五）組建人力資源和社會保障部。將人事部、勞動和社會保障部的職責整合劃入人力資源和社會保障部。組建國家公務員局，由人力資源和社會保障部管理。不再保留人事部、勞動和社會保障部。（六）組建環(huán)境保護部。不再保留國家環(huán)境保護總局。（七）組建住房和城鄉(xiāng)建設部。不再保留建設部。（八）國家食品藥品監(jiān)督管理局改由衛(wèi)生部管理。明確衛(wèi)生部承擔食品安全綜合協(xié)調、組織查處食品安全重大事故的責任。
改革后，除國務院辦公廳外，國務院組成部門設置２７個。這次國務院改革涉及調整變動的機構共１５個，正部級機構減少４個。
這次改革突出了三個重點：一是加強和改善宏觀調控，促進科學發(fā)展；二是著眼于保障和改善民生，加強社會管理和公共服務；三是按照探索職能有機統(tǒng)一的大部門體制要求，對一些職能相近的部門進行整合，實行綜合設置，理順部門職責關系。
