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華中農(nóng)業(yè)大學(xué)完成我國首個(gè)果樹基因組序列圖譜
中央政府門戶網(wǎng)站 www.nakedoat.com   2012年03月21日 21時(shí)53分   來源:新華社

    新華社武漢3月21日電(記者李鵬翔、俞儉)華中農(nóng)業(yè)大學(xué)21日對(duì)外公布了甜橙全基因組序列圖譜。華中農(nóng)大的園藝學(xué)、基因組學(xué)、生物信息學(xué)科研人員,經(jīng)過一年多的努力,破解了甜橙基因“密碼”,完成了甜橙基因組拼接與注釋,獲得了較高質(zhì)量的甜橙基因組。這是中國自主完成的第一個(gè)果樹作物基因組序列圖譜,也是世界上目前最為完整的甜橙全基因組序列圖譜。

    課題牽頭人、中國工程院院士、國家柑橘產(chǎn)業(yè)體系首席科學(xué)家、華中農(nóng)業(yè)大學(xué)教授鄧秀新說:“這標(biāo)志著我國在生物技術(shù)和功能基因組合上搭建起一個(gè)很好的科研平臺(tái),也對(duì)促進(jìn)柑橘的品種改良,全面提升產(chǎn)業(yè)競(jìng)爭(zhēng)力具有重要意義?!?/p>

    甜橙是世界第一大柑橘類型,產(chǎn)量占全世界柑橘產(chǎn)量的60%。我國是世界上重要的柑橘原生中心,2010年中國總產(chǎn)量2645萬噸,是世界柑橘第一生產(chǎn)大國。

    華中農(nóng)業(yè)大學(xué)博士徐強(qiáng)介紹說,甜橙具有多胚、雄或/和雌不育、遺傳背景高度雜合等特點(diǎn),阻礙了遺傳學(xué)及育種的發(fā)展。完整的基因組信息,作為一個(gè)遺傳框架,將為柑橘遺傳與育種改良提供科學(xué)的依據(jù)。

    華中農(nóng)業(yè)大學(xué)此次甜橙基因組測(cè)序采用全基因組鳥槍法(WGS)策略,進(jìn)行雙末端測(cè)序,得到數(shù)據(jù)總量約為200G,拼接后的序列覆蓋87%的柑橘基因組,獲得注釋的基因近3萬個(gè)。

    鄧秀新說,甜橙基因組序列圖譜的完成,如同打開了甜橙生命活動(dòng)的“黑匣子”,破解了甜橙基因“密碼”,得到了基因組合的排列順序和相關(guān)特征。對(duì)于今后研究中,有意識(shí)地鎖定甜橙成熟期、色澤、含糖量、產(chǎn)量、抗病性等農(nóng)藝性狀提供了良好的基礎(chǔ),有利于培養(yǎng)出更好、更健康的品種來。

    此次甜橙全基因組序列圖譜使中國在柑橘基因的基礎(chǔ)研究上與國際接軌?!斑@為中國將來的生物技術(shù)發(fā)展提供更多的可能,也有利于打破國外對(duì)中國的一些技術(shù)封鎖?!编囆阈抡f。21日,甜橙基因組網(wǎng)站(http:// citrus.hzau.edu.cn)已經(jīng)上網(wǎng),面向國內(nèi)的專家學(xué)者,為學(xué)術(shù)研究提供免費(fèi)數(shù)據(jù)分析。

 
 
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