新華社武漢10月13日電(記者 沈翀)由我國(guó)科學(xué)家領(lǐng)銜的白菜、甘藍(lán)和油菜全基因組測(cè)序項(xiàng)目取得階段性重大成果,項(xiàng)目組日前獲得了白菜全基因組的精細(xì)圖,甘藍(lán)和油菜全基因組的框架圖。
白菜、甘藍(lán)和油菜全基因組測(cè)序項(xiàng)目于去年9月啟動(dòng),吸引了中國(guó)農(nóng)科院、華中農(nóng)業(yè)大學(xué)、湖南大學(xué)等多所國(guó)內(nèi)研究機(jī)構(gòu)以及韓、英、加、澳、美等國(guó)的相關(guān)研究機(jī)構(gòu)科研人員參與,其中中國(guó)農(nóng)科院蔬菜花卉研究所和油料作物研究所為項(xiàng)目主持單位。
油菜、白菜和甘藍(lán)同屬于蕓薹屬作物,油菜是由白菜和甘藍(lán)雜交后進(jìn)化而來(lái)。其中白菜的基因組命名為A,甘藍(lán)的基因組命名為C,而油菜的基因組為AC。在測(cè)序技術(shù)路線上本項(xiàng)目采用了通量更高的新一代測(cè)序技術(shù)和全基因組鳥(niǎo)槍法測(cè)序策略,從而提高了測(cè)序效率。
研究表明,白菜、甘藍(lán)和油菜的基因組大小分別約為5億個(gè)、6.5億個(gè)和11億個(gè)堿基對(duì),白菜和甘藍(lán)含有的基因總數(shù)目分別約4.2萬(wàn)個(gè)和4.5萬(wàn)個(gè),油菜基因覆蓋度為85%以上。
中國(guó)農(nóng)科院蔬菜花卉研究所和油料作物研究所表示,對(duì)白菜、甘藍(lán)和油菜進(jìn)行全基因組測(cè)序是國(guó)際上首次對(duì)三個(gè)近緣作物物種進(jìn)行的整體測(cè)序,其中油菜是迄今首個(gè)全基因組測(cè)序的異源四倍體植物,這不僅對(duì)研究作物進(jìn)化和遺傳改良有著重大意義,也對(duì)其他多倍體物種的全基因組測(cè)序具有重要的參考價(jià)值。
由于項(xiàng)目進(jìn)展順利,在今年8月加拿大薩斯卡通召開(kāi)的國(guó)際白菜基因組測(cè)序聯(lián)盟會(huì)議上,各成員國(guó)一致同意以我國(guó)的測(cè)序結(jié)果為標(biāo)準(zhǔn)序列,并將各自的數(shù)據(jù)整合到我國(guó)的白菜基因組圖譜中。
項(xiàng)目組介紹,下一步的工作將是繪制甘藍(lán)和油菜的基因組精細(xì)圖。