6月20日8時—21日8時，江西東部、浙江中部、廣西南部、福建西北部、湖南南部降了大到暴雨，其中廣西浙江江西等地局部地區(qū)降了大暴雨。最大點雨量為廣西靈山176毫米，江西資溪146毫米，浙江臨海124毫米。
受強降雨影響，全國共有35條河流發(fā)生超警戒水位洪水，鄱陽湖、洞庭湖水位繼續(xù)上漲、尚未超警。其中江西全省26條河流超警，信江、撫河等6條河流發(fā)生超歷史實測記錄的大洪水，信江與撫河洪水發(fā)生頻率達到50年一遇特大洪水等級。福建閩江繼6月18日發(fā)生30年一遇大洪水之后，再次發(fā)生超警洪水，上游支流富屯溪、建溪發(fā)生超保洪水。湖南湘江、資水等發(fā)生超警洪水，其中湘江全線超警。廣西西江支流柳江、桂江發(fā)生超警洪水，西江干流水位止落回漲。
中共中央政治局委員、國務(wù)院副總理、國家防總總指揮回良玉高度關(guān)注江西省防汛抗洪情況，于6月20日電話詢問江西省汛情災(zāi)情及抗洪搶險救災(zāi)詳細情況。他要求江西省要全力做好當前防汛抗洪工作，一要繼續(xù)及時轉(zhuǎn)移人員，組織好抗洪搶險；二要妥善安置群眾，保障群眾基本生活；三要加強監(jiān)測預(yù)報，嚴防山洪地質(zhì)災(zāi)害；四要確保水庫堤壩安全，搞好巡堤查險；五要充分發(fā)揮黨員干部和部隊作用，強化組織領(lǐng)導(dǎo)。
6月20日下午，國家防總副總指揮、水利部部長陳雷從災(zāi)區(qū)指導(dǎo)防汛抗洪工作返京后，立即主持召開國家防總緊急防汛會商會議，傳達貫徹落實中央領(lǐng)導(dǎo)的重要指示精神，再次對當前全國防汛抗洪搶險工作進行安排部署，要求務(wù)必做好八項工作：一是加強會商和監(jiān)測預(yù)報，密切監(jiān)視雨情、水情、工情、險情，加強預(yù)報，以利提前作出防汛決策和部署。二是加強江河堤防巡查防守和搶險，尤其要加大水位較高或薄弱堤段巡查密度，及早發(fā)現(xiàn)和迅速處理險情。三是全力做好水庫、水電站安全度汛工作，堅持24小時巡查制度，每個小水庫都要落實專人監(jiān)守，落實搶險隊伍和物資，確保安全。四是加強山洪災(zāi)害防御，充分發(fā)揮已建監(jiān)測預(yù)警系統(tǒng)的作用，及時發(fā)布災(zāi)害預(yù)警，落實預(yù)案和群眾避險防范措施。五是切實做好人員避險轉(zhuǎn)移工作，及時轉(zhuǎn)移山洪災(zāi)害危險區(qū)、水庫下游威脅區(qū)、可能潰決圩堤內(nèi)群眾，千方百計避免和減少人員傷亡。六是加強水利工程調(diào)度，電力調(diào)度要堅決服從防洪調(diào)度，適時攔蓄、調(diào)控洪水，在確保工程安全的前提下，最大程度地發(fā)揮水利工程的防洪減災(zāi)作用。七是加強協(xié)助指導(dǎo)，水利部要舉全部之力，積極支援災(zāi)區(qū)，國家防總、水利部工作組要加強對地方抗洪搶險工作的指導(dǎo)。八是國家防總要及時調(diào)撥防汛搶險物資，滿足地方防汛抗洪工作需要。
會商會后，國家防總立即發(fā)出調(diào)令，要求三峽水庫減小泄量，減輕長江中下游防洪壓力，全力支持江西、湖南等地做好防汛抗洪搶險工作。同時向各流域防總發(fā)出通知，要求積極主動采取各項措施，切實加大防汛抗洪的指導(dǎo)力度，加強防洪工程的科學(xué)調(diào)度，全力支持地方做好防汛抗洪和搶險救災(zāi)工作。
應(yīng)江西省防汛抗旱指揮部請求，國家防總于6月19日、20日、21日連續(xù)三次從中央防汛物資倉庫緊急調(diào)運防汛搶險物資，累計調(diào)運救生沖鋒舟130艘、40馬力船外機130臺、橡皮舟290只、9.9馬力船外機170臺，船外機專用機油481箱，救生衣5000件支援該省抗洪搶險工作。
6月20日—21日，江西省先后有3個萬畝圩和1個千畝圩因超標準洪水發(fā)生漫頂決口，當?shù)卣崆稗D(zhuǎn)移區(qū)內(nèi)受威脅的3.6萬人，未造成人員傷亡。國家防總要求江西、湖南、福建等地進一步加大防洪工程的巡查和搶險力度，力求做到險情早發(fā)現(xiàn)、早處置。同時，要做好退水階段的堤防防守工作，克服麻痹思想，確保行洪安全。當日，南方受災(zāi)省區(qū)共有28.02萬人投入到搶險救災(zāi)和巡堤查險。其中，江西省有4.5萬人巡堤查險，20.8萬人搶險救災(zāi)；湖南省有2.12萬人巡堤查險；福建省有0.6萬人巡堤查險。
據(jù)國家防辦和民政部6月21日8時統(tǒng)計，6月13日以來發(fā)生的強降雨過程造成江西、福建、湖南等南方10省區(qū)遭受嚴重的洪澇災(zāi)害，累計受災(zāi)人口達2515萬人，農(nóng)作物受災(zāi)1361千公頃，因災(zāi)死亡175人、失蹤107人，轉(zhuǎn)移人口171萬人，倒塌房屋14.4萬間，直接經(jīng)濟損失約297億元。
