2001年以來，針對一些地方和部門以加強管理和服務為名，對進城務工的農(nóng)民巧立名目亂收費，農(nóng)民進城務工就業(yè)受到不合理限制，農(nóng)民工權益受到損害等問題，按照國務院的統(tǒng)一部署和要求，發(fā)展改革委（原國家計委）、財政部等部門對涉及農(nóng)民工的收費進行了全面清理和規(guī)范，聯(lián)合下發(fā)了《關于全面清理整頓外出或外來務工人員收費的通知》?！锻ㄖ芬?guī)定：取消未經(jīng)國務院和省、自治區(qū)、直轄市政府及所屬財政、價格主管部門批準的行政事業(yè)性收費項目，對符合規(guī)定權限和程序設立的行政事業(yè)性收費，也要重新審核。除證書工本費外，各地和有關部門針對進城務工人員設立的暫住費、暫?。鲃樱┤丝诠芾碣M、計劃生育管理費、城市增容費、勞動力調(diào)節(jié)費、外地務工經(jīng)商人員管理服務費、外地（外省）建筑（施工）企業(yè)管理費等收費項目一律取消；為進城務工人員提供經(jīng)營性服務的收費必須符合自愿有償原則，堅決糾正強行服務、強制收費的行為。2002年，全國累計取消了暫住費、暫?。鲃樱┤丝诠芾碣M、計劃生育管理費、城市增容費、勞動力調(diào)節(jié)費、外地務工經(jīng)商人員管理服務費、外地（外?。┙ㄖㄊ┕ぃ┢髽I(yè)管理費等120多項收費，當年減輕務工人員負擔50億元。
2004年，針對清理整頓中存在的一些矛盾和問題，財政部發(fā)布了《關于規(guī)范收費管理促進農(nóng)民增加收入的通知》，要求各地繼續(xù)清理和取消針對農(nóng)民進城就業(yè)的不合理收費，切實保障進城就業(yè)農(nóng)民的合法權益。主要包括：對進城就業(yè)的農(nóng)民除每證收取最高不超過5元的暫住證工本費和流動人口婚育證明工本費外，其他專門面向進城就業(yè)農(nóng)民的行政事業(yè)性收費項目，如對農(nóng)民工收取的健康證工本費、審查費、工資管理費、臨時工管理費、勞動力管理費、調(diào)配費、衛(wèi)生費等，一律取消，并清退向農(nóng)民違規(guī)收取的款項；嚴禁向進城就業(yè)農(nóng)民或農(nóng)民工所在單位收取治安聯(lián)防費等。
在此基礎上，根據(jù)黨中央、國務院有關指示精神，2004年財政部、發(fā)展改革委發(fā)布了《關于公布取消103項行政審批等收費項目的通知》，明確要取消針對農(nóng)民工收取的《流動人口婚育證明》工本費；發(fā)展改革委、財政部等9部委聯(lián)合發(fā)布了《關于進一步清理和取消針對農(nóng)民跨地區(qū)就業(yè)和進城務工歧視性規(guī)定和不合理收費的通知》，明確除法律法規(guī)規(guī)定的外，各地設立的針對農(nóng)民跨地區(qū)就業(yè)和進城務工的各種行政許可和非行政許可審批事項，一律取消；按法律法規(guī)規(guī)定保留的涉及農(nóng)民跨地區(qū)就業(yè)和進城務工的手續(xù)，要按照"規(guī)范程序、公開透明、方便辦理"的原則進行簡化。（發(fā)展改革委、財政部提供）
