２００８年３月１１日，十一屆全國人大一次會議聽取了國務(wù)委員兼國務(wù)院秘書長華建敏關(guān)于國務(wù)院機構(gòu)改革方案的說明，３月１５日，會議通過關(guān)于國務(wù)院機構(gòu)改革方案的決定，批準(zhǔn)了這個方案。
國務(wù)院機構(gòu)改革是深化行政管理體制改革的重要組成部分。按照精簡統(tǒng)一效能的原則和決策權(quán)、執(zhí)行權(quán)、監(jiān)督權(quán)既相互制約又相互協(xié)調(diào)的要求，著力優(yōu)化組織結(jié)構(gòu)，規(guī)范機構(gòu)設(shè)置，完善運行機制，為全面建設(shè)小康社會提供組織保障。深化行政管理體制改革的總體目標(biāo)是，到２０２０年建立起比較完善的中國特色社會主義行政管理體制。
這次國務(wù)院機構(gòu)改革的主要任務(wù)是，圍繞轉(zhuǎn)變政府職能和理順部門職責(zé)關(guān)系，探索實行職能有機統(tǒng)一的大部門體制，合理配置宏觀調(diào)控部門職能，加強能源環(huán)境管理機構(gòu)，整合完善工業(yè)和信息化、交通運輸行業(yè)管理體制，以改善民生為重點加強與整合社會管理和公共服務(wù)部門。
國務(wù)院機構(gòu)改革方案主要內(nèi)容包括：（一）合理配置宏觀調(diào)控部門職能。國家發(fā)展和改革委員會要進一步轉(zhuǎn)變職能，減少微觀管理事務(wù)和具體審批事項，集中精力抓好宏觀調(diào)控。財政部要改革完善預(yù)算和稅政管理，健全中央和地方財力與事權(quán)相匹配的體制，完善公共財政體系。中國人民銀行要進一步健全貨幣政策體系，加強與金融監(jiān)管部門的統(tǒng)籌協(xié)調(diào)，維護國家金融安全。國家發(fā)展和改革委員會、財政部、中國人民銀行等部門要建立健全協(xié)調(diào)機制，形成更加完善的宏觀調(diào)控體系。（二）加強能源管理機構(gòu)。設(shè)立高層次議事協(xié)調(diào)機構(gòu)國家能源委員會。組建國家能源局，由國家發(fā)展和改革委員會管理。將國家發(fā)展和改革委員會的能源行業(yè)管理有關(guān)職責(zé)及機構(gòu)，與國家能源領(lǐng)導(dǎo)小組辦公室的職責(zé)、國防科學(xué)技術(shù)工業(yè)委員會的核電管理職責(zé)進行整合，劃入該局。國家能源委員會辦公室的工作由國家能源局承擔(dān)。不再保留國家能源領(lǐng)導(dǎo)小組及其辦事機構(gòu)。（三）組建工業(yè)和信息化部。將國家發(fā)展和改革委員會的工業(yè)行業(yè)管理有關(guān)職責(zé)，國防科學(xué)技術(shù)工業(yè)委員會核電管理以外的職責(zé)，信息產(chǎn)業(yè)部和國務(wù)院信息化工作辦公室的職責(zé)，整合劃入工業(yè)和信息化部。組建國家國防科技工業(yè)局，由工業(yè)和信息化部管理。國家煙草專賣局改由工業(yè)和信息化部管理。不再保留國防科學(xué)技術(shù)工業(yè)委員會、信息產(chǎn)業(yè)部、國務(wù)院信息化工作辦公室。（四）組建交通運輸部。將交通部、中國民用航空總局的職責(zé)，建設(shè)部的指導(dǎo)城市客運職責(zé)，整合劃入交通運輸部。組建國家民用航空局，由交通運輸部管理。國家郵政局改由交通運輸部管理。保留鐵道部，繼續(xù)推進改革。不再保留交通部、中國民用航空總局。（五）組建人力資源和社會保障部。將人事部、勞動和社會保障部的職責(zé)整合劃入人力資源和社會保障部。組建國家公務(wù)員局，由人力資源和社會保障部管理。不再保留人事部、勞動和社會保障部。（六）組建環(huán)境保護部。不再保留國家環(huán)境保護總局。（七）組建住房和城鄉(xiāng)建設(shè)部。不再保留建設(shè)部。（八）國家食品藥品監(jiān)督管理局改由衛(wèi)生部管理。明確衛(wèi)生部承擔(dān)食品安全綜合協(xié)調(diào)、組織查處食品安全重大事故的責(zé)任。
改革后，除國務(wù)院辦公廳外，國務(wù)院組成部門設(shè)置２７個。這次國務(wù)院改革涉及調(diào)整變動的機構(gòu)共１５個，正部級機構(gòu)減少４個。
這次改革突出了三個重點：一是加強和改善宏觀調(diào)控，促進科學(xué)發(fā)展；二是著眼于保障和改善民生，加強社會管理和公共服務(wù)；三是按照探索職能有機統(tǒng)一的大部門體制要求，對一些職能相近的部門進行整合，實行綜合設(shè)置，理順部門職責(zé)關(guān)系。
