１９６０年到１９６４年，為了貫徹國民經(jīng)濟調(diào)整的方針，進行了建國后的第三次較大機構(gòu)改革。
一是先后在中央和地方各級機關(guān)進行了兩次比較集中的干部精簡運動。第一次是１９６０年７月至１９６１年９月，主要集中在中央一級機關(guān)。這次干部精簡以事業(yè)單位為重點，對行政部門和事業(yè)單位同時進行精簡。經(jīng)過一年多的努力，在機構(gòu)方面，中央各部門司局級機關(guān)減少１５％，事業(yè)單位減少２６％；行政機關(guān)精簡１．６萬余人，事業(yè)單位精簡６．５萬余人。第二次精簡從１９６２年２月至１９６４年，范圍包括中央和地方各級機關(guān)。經(jīng)過近兩年時間的努力，中央國家機關(guān)在１９６１年精簡的基礎(chǔ)上，又精簡了１萬人。全國共精簡８１萬人。精簡下來的干部大多數(shù)充實到基層和生產(chǎn)第一線。
二是中央收回五十年代后期下放給地方的權(quán)力并恢復(fù)被撤銷的機構(gòu)，到１９６５年底，國務(wù)院的機構(gòu)數(shù)達到７９個，為建國后的第二次高峰。
