新華社上海8月31日電(記者 羅爭(zhēng)光)如何可靠地檢測(cè)新近發(fā)生的自然選擇?記者31日從中國(guó)科學(xué)院上海生命科學(xué)研究院計(jì)算生物學(xué)研究所了解到,李海鵬研究員的最新研究成果,圓了這個(gè)理論群體遺傳學(xué)界20年來(lái)的夢(mèng)想。
研究人員介紹說(shuō),在生命的進(jìn)化過(guò)程中,達(dá)爾文的自然選擇是一種重要的進(jìn)化力量,它使得攜帶某個(gè)突變的個(gè)體相對(duì)于不攜帶這個(gè)突變的個(gè)體來(lái)說(shuō)有生存和繁殖上的優(yōu)勢(shì)。它不僅在野生群體和現(xiàn)代人類的進(jìn)化過(guò)程中扮演著重要的角色,而且在家養(yǎng)動(dòng)植物(如稻米、狗和豬)的培育及馴化過(guò)程中均起著決定性的作用。通過(guò)留在生物體基因組里的關(guān)于自然選擇事件的“蛛絲馬跡”,我們可以研究這些基因突變的功能,并最終探索進(jìn)化的根本奧秘——適應(yīng)性進(jìn)化的分子生物學(xué)機(jī)制。
目前在檢測(cè)自然選擇事件的時(shí)候,一個(gè)關(guān)鍵的研究障礙在于,需要事先估計(jì)出研究對(duì)象長(zhǎng)期進(jìn)化過(guò)程中群體數(shù)量的變化,以提高自然選擇檢驗(yàn)的可信度。然而,即使采用目前的在基因組水平上遺傳多態(tài)數(shù)據(jù)的分析方法,仍然難以精確估計(jì)出分析過(guò)程中具體的假陽(yáng)性率,因而也就難以提高相關(guān)研究的精確度。
在過(guò)去20多年里,理論群體遺傳學(xué)研究的一個(gè)主要目標(biāo),就是要建立一個(gè)行之有效的方法,使得檢測(cè)新近發(fā)生的自然選擇不受群體數(shù)量變化的影響。李海鵬的研究成果將這一夢(mèng)想變成了現(xiàn)實(shí)。
據(jù)介紹,李海鵬提出了一種全新的通過(guò)檢驗(yàn)樹(shù)的拓?fù)浣Y(jié)構(gòu)策略來(lái)檢測(cè)新近發(fā)生的自然選擇,并建立了相應(yīng)的統(tǒng)計(jì)學(xué)方法。數(shù)學(xué)和計(jì)算機(jī)模擬兩方面均證明,該統(tǒng)計(jì)學(xué)假設(shè)檢驗(yàn)的結(jié)果不受群體歷史數(shù)量變動(dòng)的影響。這意味著無(wú)論群體的數(shù)量在歷史上如何變動(dòng),這一新方法的假陽(yáng)性率將保持在統(tǒng)計(jì)學(xué)假設(shè)檢驗(yàn)時(shí)所設(shè)的顯著性水平以下。
而且,新的方法不需要任何種群歷史的信息或者對(duì)種群參數(shù)的估計(jì),也無(wú)需基因組水平的遺傳多態(tài)數(shù)據(jù),僅僅需要來(lái)自于一個(gè)DNA片段的遺傳多態(tài)數(shù)據(jù),就可以可靠地檢測(cè)新近發(fā)生的自然選擇。
目前,這一研究成果已經(jīng)發(fā)表在影響因子為9.872的MBE(Molecular Biology and Evolution)雜志上。