絨毛狀煙草和林煙草全基因組序列圖譜已經(jīng)由中國煙草完成。這是全球第一套煙草全基因組序列圖譜，也是繼馬鈴薯和番茄基因組之后全球完成的第三種茄科植物全基因組序列圖譜。該絨毛狀煙草和林煙草全基因組序列圖譜是目前已知植物基因組序列圖譜中基因組最大、組裝精度最高、組裝結(jié)果最好的2個(gè)圖譜。絨毛狀煙草和林煙草是栽培煙草的兩個(gè)祖先種，絨毛狀煙草和林煙草全基因組序列圖譜的完成，具有重要的科學(xué)價(jià)值和戰(zhàn)略意義，將開創(chuàng)煙草科學(xué)研究和技術(shù)發(fā)展的新紀(jì)元，是煙草科學(xué)發(fā)展的一個(gè)重要里程碑，標(biāo)志著煙草研究從此全面進(jìn)入基因組時(shí)代。
絨毛狀煙草和林煙草全基因組序列圖譜是中國煙草同世界上測序能力最強(qiáng)、最具權(quán)威的基因組測序機(jī)構(gòu)合作完成。根據(jù)煙草基因組重復(fù)序列含量較高和基因組較大等特點(diǎn)，通過Illumina第二代高通量測序技術(shù)，采用全基因組鳥槍法（WGS）結(jié)合構(gòu)建細(xì)菌人工染色體（BAC to BAC）策略進(jìn)行測序和組裝工作。利用全基因組鳥槍法（WGS）策略構(gòu)建不同長度的插入片段文庫進(jìn)行雙末端測序和組裝，同時(shí)選取一定基因組覆蓋度的BAC克隆，對BAC克隆進(jìn)行測序和組裝，然后將兩種數(shù)據(jù)結(jié)合進(jìn)行深度組裝，最終獲得高質(zhì)量煙草全基因組序列圖譜，實(shí)現(xiàn)對單堿基的高深度重復(fù)測序，保證單堿基的高準(zhǔn)確率。經(jīng)數(shù)據(jù)分析，獲得絨毛狀煙草和林煙草基因組大小均為2.4Gb，基因組常染色質(zhì)區(qū)覆蓋度達(dá)到95%以上，基因區(qū)覆蓋度達(dá)到98%以上，獲得的全基因組序列圖譜（第一版）contig N50超過20kb，scaffold N50超過350kb，全面達(dá)到國際公認(rèn)高質(zhì)量精細(xì)圖譜標(biāo)準(zhǔn)，是目前已知植物基因組序列圖譜中基因組最大、組裝精度最高、組裝結(jié)果最好的2個(gè)圖譜，居世界領(lǐng)先地位。根據(jù)目前工作基礎(chǔ)，預(yù)計(jì)在年底前可獲得序列圖譜（第二版），預(yù)計(jì)scaffold N50將達(dá)到1M以上，較第一版圖譜有顯著提高。
絨毛狀煙草和林煙草全基因組序列圖譜是中國煙草基因組計(jì)劃的一部分。中國煙草基因組計(jì)劃作為煙草行業(yè)的重大專項(xiàng)，是中國煙草舉全行業(yè)之力開展的重大科研攻關(guān)，于2010年12月9日啟動(dòng)，迄今整整一周年。中國煙草基因組計(jì)劃由國家煙草基因研究中心、中國煙草總公司青州煙草研究所、云南煙草農(nóng)業(yè)科學(xué)研究院、貴州省煙草科研所、黑龍江省煙草科學(xué)研究所等單位為主體承擔(dān)，匯集了國內(nèi)外的權(quán)威專家，密切跟蹤當(dāng)前基因組學(xué)、生物信息學(xué)、遺傳學(xué)等學(xué)科的前沿進(jìn)展，本著對科學(xué)負(fù)責(zé)、對歷史負(fù)責(zé)、對行業(yè)負(fù)責(zé)的態(tài)度，在煙草結(jié)構(gòu)基因組學(xué)、功能基因組學(xué)和分子育種方面進(jìn)行了整體規(guī)劃和系統(tǒng)實(shí)施，保證從技術(shù)到系統(tǒng)全面居于世界領(lǐng)先水平，目前重大專項(xiàng)已經(jīng)在多個(gè)領(lǐng)域取得突破性進(jìn)展和成果。在已經(jīng)獲得林煙草和絨毛狀煙草全基因組序列圖譜的基礎(chǔ)上，絨毛狀煙草和林煙草的遺傳圖譜和物理圖譜繪制、大量四倍體栽培煙草的基因組測序?qū)⒂行蜷_展；煙草突變體庫創(chuàng)制已達(dá)27萬份并正在進(jìn)行大規(guī)模鑒定和分析；煙草分子遺傳圖譜構(gòu)建和重要突變基因定位克隆取得突破；根據(jù)第一版基因組圖譜及多個(gè)樣本的深度轉(zhuǎn)錄組測序的聯(lián)合分析，對煙草主要代謝產(chǎn)物的合成代謝途徑分析更加深入，對煙草減害具有十分重要的意義。總體上看，煙草基因組計(jì)劃重大專項(xiàng)的各項(xiàng)進(jìn)展和成果均處于世界煙草科技前沿。
長期以來，中國煙草倡導(dǎo)并踐行“國家利益至上，消費(fèi)者利益至上”的行業(yè)共同價(jià)值觀，致力于降低煙草危害、維護(hù)消費(fèi)者利益和國家利益。實(shí)施煙草基因組計(jì)劃，破譯煙草遺傳密碼，培育“優(yōu)質(zhì)、特色、低害、豐產(chǎn)、高效、多抗”的優(yōu)質(zhì)超級煙草品種，不僅能滿足卷煙工業(yè)的需要，更有助于從根本上降低煙草危害，是責(zé)任煙草的具體體現(xiàn)。同時(shí)，煙草是重要的科研模式植物，絨毛狀煙草和林煙草全基因組序列圖譜的完成，尤其是中國煙草基因組計(jì)劃的實(shí)施，將對相關(guān)作物學(xué)科的發(fā)展起到積極的推動(dòng)作用。
