2009年7月18日，科技部與云南省人民政府在昆明舉行了第二次部省工作會(huì)商會(huì)議。全國政協(xié)副主席、科技部部長萬鋼，科技部黨組成員、副部長張來武；中共云南省委副書記、省長秦光榮，副省長和段琪等出席了會(huì)議。會(huì)議由科技部副部長張來武主持。
萬鋼部長在講話中充分肯定了云南省的科技工作，尤其是在科技創(chuàng)新環(huán)境營造、著力培育特色優(yōu)勢(shì)產(chǎn)業(yè)等方面所取得的重要突破。他指出，面對(duì)云南快速發(fā)展的新形勢(shì)、新機(jī)遇，科技部將以十七大精神為指引，以部省會(huì)商為平臺(tái)，進(jìn)一步加強(qiáng)與云南省的合作與互動(dòng)，促進(jìn)云南科技創(chuàng)新。希望云南認(rèn)真貫徹落實(shí)《國務(wù)院關(guān)于發(fā)揮科技支撐作用 促進(jìn)經(jīng)濟(jì)平穩(wěn)較快發(fā)展的意見》，立足優(yōu)勢(shì)特色產(chǎn)業(yè)，調(diào)整投入結(jié)構(gòu)，集成資源，調(diào)動(dòng)各方面積極性，提升科技在經(jīng)濟(jì)社會(huì)發(fā)展中的支撐作用；進(jìn)一步抓好生物資源開發(fā)、有色金屬、磷化工和煤化工、先進(jìn)制造等重點(diǎn)領(lǐng)域的跨越發(fā)展，重視重大專項(xiàng)等科技成果在這些領(lǐng)域的推廣和應(yīng)用；進(jìn)一步營造好科技創(chuàng)新氛圍，切實(shí)加強(qiáng)自主創(chuàng)新政策的落實(shí)，并在符合自身發(fā)展需求方面取得突破。
秦光榮省長在講話中首先感謝科技部對(duì)云南科技工作的大力支持。他指出會(huì)商制度建立兩年多來，云南省在制定和完善政策、加大財(cái)政科技投入、促進(jìn)科技與金融結(jié)合、擴(kuò)大科技領(lǐng)域的開放合作及進(jìn)一步深化科技管理改革等方面進(jìn)行了探索和創(chuàng)新，有力地促進(jìn)了云南的科技進(jìn)步和科技工作，形成了上下聯(lián)動(dòng)、橫向互動(dòng)的工作格局。他指出云南將以此為契機(jī)，按照國家目標(biāo)和云南優(yōu)勢(shì)相結(jié)合的原則，進(jìn)一步深化與科技部的合作，圍繞議定書的主題和內(nèi)容，加強(qiáng)領(lǐng)導(dǎo)，增加投入，創(chuàng)新機(jī)制，狠抓落實(shí)，舉全省之力，確保與科技部合作共建的重大項(xiàng)目的實(shí)施和重點(diǎn)工作的開展，共同為建設(shè)創(chuàng)新型國家作出貢獻(xiàn)。
會(huì)上，科技部與云南省圍繞“共同推進(jìn)云南有色金屬新材料產(chǎn)業(yè)化基地建設(shè)”、“推動(dòng)中藥現(xiàn)代化科技產(chǎn)業(yè)（云南）基地建設(shè)”、“繼續(xù)推進(jìn)云南特色動(dòng)物資源實(shí)驗(yàn)動(dòng)物化開發(fā)及共享平臺(tái)建設(shè)”、“共同推進(jìn)云南省興邊富民科技支撐工作”、“優(yōu)化科技發(fā)展環(huán)境，加強(qiáng)體制機(jī)制創(chuàng)新”等合作重點(diǎn)進(jìn)行了深入溝通和交流。
