為切實(shí)落實(shí)溫家寶總理加快長三角地區(qū)發(fā)展的指示精神，配合《關(guān)于進(jìn)一步推進(jìn)長三角地區(qū)改革開放和社會經(jīng)濟(jì)發(fā)展的指導(dǎo)意見》（簡稱《意見》）的起草工作，按照國家發(fā)改委和國務(wù)院研究室的統(tǒng)一部署，科技部負(fù)責(zé)牽頭組織“增強(qiáng)自主創(chuàng)新能力專題”的研究和起草工作。為了切實(shí)了解情況，廣泛聽取意見，2007年6月11日－15日，科技部發(fā)展計(jì)劃司會同發(fā)改委、財(cái)政部、教育部、國家知識產(chǎn)權(quán)局、環(huán)保總局等相關(guān)部門和滬蘇浙科技主管部門共同組成的專題工作組，赴長三角地區(qū)開展專題調(diào)研。調(diào)研組在計(jì)劃司副司長許倞和副巡視員劉金林同志帶領(lǐng)下，在上海、杭州、蘇州、無錫、南京等地深入多家企業(yè)、研發(fā)機(jī)構(gòu)、高新區(qū)、創(chuàng)新創(chuàng)業(yè)服務(wù)機(jī)構(gòu)進(jìn)行實(shí)地調(diào)研，召開6次由地方政府部門、科研單位、企業(yè)、大學(xué)等參加的座談會，廣泛聽取了各方意見，參會人員超過了150人次。
“長三角”地區(qū)的科技力量、研發(fā)投入和研發(fā)機(jī)構(gòu)，都占全國1/4左右；專利申請量和授權(quán)量占全國總量的1/4以上；高新技術(shù)產(chǎn)品出口占了總量的近一半。近年來，長三角地區(qū)在推動區(qū)域創(chuàng)新體系建設(shè)方面做了積極而有益的探索。如簽訂了《滬蘇浙共同推進(jìn)長三角創(chuàng)新體系建設(shè)協(xié)議書》，建立了“長三角創(chuàng)新體系建設(shè)的聯(lián)席會議”制度，在科技基礎(chǔ)條件平臺建設(shè)、共建網(wǎng)上技術(shù)市場、互認(rèn)高新技術(shù)企業(yè)等方面取得了實(shí)質(zhì)性進(jìn)展。
調(diào)研過程中，來自于地方部門、科研單位、大學(xué)、中介機(jī)構(gòu)、企業(yè)的各方面代表對增強(qiáng)長三角自主創(chuàng)新能力，加快長三角率先發(fā)展、科學(xué)發(fā)展提出了很多有建設(shè)性的建議。如推動自主創(chuàng)新政策在長三角地區(qū)先行先試、加強(qiáng)對長三角區(qū)域科技合作的引導(dǎo)、聯(lián)合組織重大科技工程、實(shí)施創(chuàng)新人才建設(shè)行動等等。
6月15日，發(fā)改委和國務(wù)院研究室組織召開了起草《意見》的工作會，聽取了各專題牽頭部門和長三角兩省一市的工作進(jìn)展情況匯報(bào)。會議認(rèn)為，增強(qiáng)自主創(chuàng)新能力對長三角地區(qū)率先發(fā)展、科學(xué)發(fā)展非常重要，對專題前期調(diào)研工作和成果給予了充分肯定?？萍疾繉⒃诖嘶A(chǔ)上，按照工作總體部署，協(xié)調(diào)相關(guān)部門提出增強(qiáng)長三角地區(qū)自主創(chuàng)新能力的具體政策意見。
