經(jīng)國務院批準，“國家轉(zhuǎn)基因植物研究與產(chǎn)業(yè)化”專項于1999年啟動實施，中央財政投入5.1億元，部門、地方和社會配套投入3.2億元，重點開展功能基因克隆、轉(zhuǎn)基因新產(chǎn)品培育和產(chǎn)業(yè)化、轉(zhuǎn)基因植物安全性評價以及轉(zhuǎn)基因研發(fā)能力建設(shè)等工作?？萍疾亢拓斦繒r(nóng)業(yè)部、教育部、衛(wèi)生部、中國科學院、質(zhì)檢總局、環(huán)?？偩?、林業(yè)局以及地方科技部門，組織全國的轉(zhuǎn)基因優(yōu)勢力量，于2006年底超額完成了專項目標和任務，取得了巨大的科技、經(jīng)濟和社會效益。
一、轉(zhuǎn)基因科技達到國際先進水平，在發(fā)展中國家處于領(lǐng)先地位
1. 植物重要功能基因克隆取得重要進展，掌握了轉(zhuǎn)基因植物研究與產(chǎn)業(yè)化發(fā)展的主動權(quán)。統(tǒng)計顯示專項實施7年來，已自主克隆重要功能基因418個。其中，抗蟲相關(guān)基因46個、抗病相關(guān)基因57個、抗非生物逆境基因162個、生長發(fā)育相關(guān)基因78個、品質(zhì)與高產(chǎn)相關(guān)基因71個、抗除草劑基因4個。共申請專利295項，其中公開52項，進入實審22項，授權(quán)9項。在這些基因中，已有轉(zhuǎn)化植株并將對植物優(yōu)質(zhì)、高產(chǎn)、抗逆及生長發(fā)育調(diào)控等具有重要應用前景的功能基因46個。其中水稻分蘗基因MOC1的研究成果發(fā)表在《Nature》雜志上，耐低鉀脅迫相關(guān)基因克隆方面的研究成果發(fā)表在《Cell》雜志上，在國際上產(chǎn)生了重要的影響。
2．轉(zhuǎn)基因技術(shù)創(chuàng)新取得了一批標志性成果，奠定了轉(zhuǎn)基因產(chǎn)業(yè)化發(fā)展的技術(shù)基礎(chǔ)。專項在基因高效轉(zhuǎn)化、選擇標記基因刪除技術(shù)、目的基因產(chǎn)物定時降解技術(shù)、大豆葉綠體轉(zhuǎn)化技術(shù)、植物組織特異性優(yōu)勢表達技術(shù)等轉(zhuǎn)基因技術(shù)方面取得了一批重要成果，共申請國家發(fā)明專利96項，其中公開16項，進入實審14項，授權(quán)8項。特別是在多基因轉(zhuǎn)化技術(shù)方面的研究成果達到國際領(lǐng)先水平，相關(guān)研究成果發(fā)表在《PNAS》等國際著名雜志上；“棉花規(guī)模化轉(zhuǎn)基因技術(shù)”優(yōu)化了棉花轉(zhuǎn)基因技術(shù)體系，大大提高了轉(zhuǎn)化效率，獲得2006年國家科技進步二等獎。這批成果大大提升了我國轉(zhuǎn)基因技術(shù)水平和國際影響力。
二、轉(zhuǎn)基因抗蟲棉產(chǎn)業(yè)化取得巨大的經(jīng)濟效益，初步具備主要作物的轉(zhuǎn)基因產(chǎn)業(yè)化能力
1. 轉(zhuǎn)基因抗蟲棉產(chǎn)業(yè)化創(chuàng)經(jīng)濟效益150億元以上，并為農(nóng)民增收、棉紡工業(yè)發(fā)展和生態(tài)環(huán)境改善作出重大貢獻。在專項的支持下，培育了轉(zhuǎn)基因抗蟲棉新品種55個。截至2005年，國產(chǎn)抗蟲棉占我國抗蟲棉市場份額由1998年的5％增長到70%，已累計推廣1億多畝，其中黃淮海和長江流域兩大棉區(qū)已基本實現(xiàn)轉(zhuǎn)基因抗蟲棉的推廣種植，直接為棉農(nóng)帶來收益150億元?？瓜x棉的推廣應用，提高了優(yōu)質(zhì)棉花生產(chǎn)率，為促進我國棉紡織品出口、減少優(yōu)質(zhì)原棉進口而帶來間接經(jīng)濟效益200多億元。同時，使棉農(nóng)因防治棉鈴蟲而導致的中毒事件降低了70%—80%，每年減少化學農(nóng)藥用量2000—3000萬公斤，相當于我國化學殺蟲劑年生產(chǎn)總量的7.5%左右。
2. 獲得了一批優(yōu)質(zhì)、高抗的轉(zhuǎn)基因作物育種新材料，為轉(zhuǎn)基因植物產(chǎn)業(yè)化提供了充分的品種儲備。創(chuàng)制了優(yōu)質(zhì)、抗病、抗蟲、抗旱、耐鹽、抗除草劑轉(zhuǎn)基因植物新品種、新品系和新材料20925份，共有473份新品系和新材料獲準進行生物安全性評價，其中商業(yè)化生產(chǎn)58例，環(huán)境釋放114例，中間試驗199例，生產(chǎn)性試驗102例。轉(zhuǎn)基因741楊通過了商品化生產(chǎn)審批，已推廣4000余畝，并獲2004年度國家發(fā)明二等獎。專項不僅為我國轉(zhuǎn)基因植物研究和產(chǎn)業(yè)化的發(fā)展奠定了良好的基礎(chǔ)，而且為我國農(nóng)作物品種更新?lián)Q代、農(nóng)業(yè)結(jié)構(gòu)調(diào)整以及國家生態(tài)環(huán)境建設(shè)提供了充足的品種儲備。
三、轉(zhuǎn)基因植物研發(fā)能力建設(shè)取得突出成效
1. 完成了兩個國家植物基因研究中心、兩個國家轉(zhuǎn)基因植物中試與產(chǎn)業(yè)化基地的建設(shè)任務。專項分別在北京、武漢建成了國家植物基因研究中心，在吉林建成了國家玉米、大豆轉(zhuǎn)基因中試與產(chǎn)業(yè)化基地，在河南建成了國家棉花轉(zhuǎn)基因中試與產(chǎn)業(yè)化基地。2個中心和2個基地的儀器設(shè)備和實驗條件達到了國際一流水平，運行良好，已成為我國轉(zhuǎn)基因植物研究與產(chǎn)業(yè)化的排頭兵，為提升我國轉(zhuǎn)基因植物研究和產(chǎn)業(yè)化水平發(fā)揮了重要作用。在專項支持下，我國轉(zhuǎn)基因研究和產(chǎn)業(yè)化優(yōu)勢單位裝備水平已得到顯著改善，并為國家“轉(zhuǎn)基因生物新品種培育”重大專項的實施奠定了較好的設(shè)備條件。
2. 培養(yǎng)了一批轉(zhuǎn)基因植物研究及產(chǎn)業(yè)化的主力軍，為我國今后轉(zhuǎn)基因研發(fā)提供了充足的人才戰(zhàn)略儲備。專項實施以來，吸引了一批國外的優(yōu)秀人才回國工作，培養(yǎng)高級人才980人、研究生2476人，形成了一支具有國際競爭力的轉(zhuǎn)基因植物研發(fā)隊伍。同時，通過專項的實施，一大批從事轉(zhuǎn)基因研究的中青年科學家嶄露頭角，為我國在未來轉(zhuǎn)基因研發(fā)和產(chǎn)業(yè)化的全球競爭中提高了充足的人才戰(zhàn)略儲備。
