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一、為進一步規(guī)范對外商投資企業(yè)和外國企業(yè)（以下簡稱涉外企業(yè)）稅務審計，提高稅收征管效率，減輕納稅人負擔，優(yōu)化涉外企業(yè)稅收管理環(huán)境，根據(jù)《中華人民共和國稅收征收管理法》及其實施細則，特制定本辦法。
二、聯(lián)合稅務審計的類型，分為以下兩種情況：
（一） 對跨區(qū)域經(jīng)營并實行匯總（合并）繳納企業(yè)所得稅的涉外企業(yè)，各主管稅務機關同期開展的稅務審計（以下稱為跨區(qū)域聯(lián)合稅務審計）；
（二） 對在同一地區(qū)經(jīng)營的涉外企業(yè)，負責稅收征管的國稅局和地稅局聯(lián)合開展的稅務審計（以下稱為國地稅聯(lián)合稅務審計）。
三、跨區(qū)域聯(lián)合稅務審計的組織形式
跨區(qū)域聯(lián)合稅務審計由主管企業(yè)所得稅的稅務機關組織實施，主要適用于企業(yè)所得稅的審計，但在實施審計時也應對本稅務機關其他主管稅種一并進行審計。
組織實施跨區(qū)域聯(lián)合稅務審計的稅務機關沒有下達跨區(qū)域聯(lián)合稅務審計任務通知書的，各地下級主管稅務機關不得自行安排稅務審計。組織實施跨區(qū)域聯(lián)合稅務審計的稅務機關為：
（一） 對跨?。ê灾螀^(qū)、直轄市和計劃單列市）經(jīng)營的涉外企業(yè)的稅務審計，由國家稅務總局組織實施。
（二） 對跨地（市）經(jīng)營的涉外企業(yè)的稅務審計，由省級（含計劃單列市）稅務局組織實施。
（三） 對跨縣（市）經(jīng)營的涉外企業(yè)的稅務審計，由地（市）級稅務局組織實施。
跨區(qū)域聯(lián)合稅務審計時，凡遇有涉及非本稅務機關主管稅種問題的，應告知其主管稅務機關，并在必要時聯(lián)合進行相關稅務審計。
四、國地稅聯(lián)合稅務審計的組織形式
（一） 對企業(yè)所得稅和其主體業(yè)務適用的流轉稅均由同一稅務局主管的涉外企業(yè)，由該主管稅務局提出稅務審計計劃并告知企業(yè)其他適用稅種的主管稅務局后，組織相關主管稅務局聯(lián)合開展稅務審計。
（二） 對企業(yè)所得稅和其主體業(yè)務適用的流轉稅由國稅局、地稅局分別主管的涉外企業(yè)，由主管國稅局和地稅局共同提出稅務審計計劃，聯(lián)合組織實施稅務審計。
五、實施跨區(qū)域聯(lián)合稅務審計的，負責組織實施的稅務機關可以采取以下兩種方式：一是抽調各有關主管稅務機關人力，統(tǒng)籌安排稅務審計；二是規(guī)定聯(lián)合稅務審計時限，由各主管稅務機關在規(guī)定的時限內開展稅務審計。
審計結束后，由涉外企業(yè)匯總繳納稅款所在地主管稅務機關負責匯總編制稅務審計有關文書，送達該涉外企業(yè)，辦理稅款退補、滯納金和罰款入庫事宜。
六、國地稅實施聯(lián)合稅務審計的，國稅局、地稅局主管稅務機關分別抽調人力，同時進入審計現(xiàn)場，分別負責相關事項的稅務審計。審計過程中，涉外企業(yè)的主管國稅局和地稅局，應加強溝通，共同研究審計結論和審計報告，凡涉及相同的涉稅指標，口徑和數(shù)據(jù)應該保持一致。審計結束后，涉外企業(yè)主管國稅局和地稅局分別編制稅務審計有關文書，送達企業(yè)，辦理稅款退補、滯納金和罰款入庫事宜。
七、開展聯(lián)合稅務審計時，均應按照《涉外稅務審計規(guī)程》的要求編制稅務文書，并選用適當?shù)膶徲嫹椒ê图夹g；凡涉及相同的稅務審計文書，應該一式多份，確保成果共享。
八、對同一涉外企業(yè)的聯(lián)合稅務審計，一個納稅年度內不得超過一次。
九、本辦法不適用稅務機關對涉稅案件的稽查。
十、本辦法由國家稅務總局負責解釋。
十一、本辦法自頒布之日起施行。
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